Conscient que le partenariat est le meilleur instrument du désenclavement scientifique, l’Institut Pasteur de Tunis a toujours œuvré pour tisser et développer des relations étroites de coopération avec de nombreuses institutions de recherche nationales et étrangères. Cette coopération a permis d’insérer les actions de Recherche et de Santé Publique de l’IPT dans leur contexte régional et international et a été un puissant facteur de motivation et d’émulation des chercheurs. En outre, elle a apporté des opportunités de formation complémentaire aux étudiants et jeunes chercheurs et un complément de financement aux programmes de Recherche 

Depuis sa création, l’IPT a contribué, par son savoir-faire et par sa mission de formation et d’enseignement, à l’essor de nouvelles institutions Tunisiennes d’enseignement et de recherche dans le domaine de la santé. Ceci a été à l’origine de l’établissement de liens étroits et de collaboration avec notamment :

                Les facultés de médecine
                Les facultés des sciences biologiques
                Les centres hospitalo-universitaires
                Le Centre de Biotechnologie de Sfax
                L’Ecole Nationale de Médecine Vétérinaire
                La faculté de pharmacie de Monastir
                L’Institut National des Sciences Appliqués de Tunis