Laboratoire de Génomique Biomédicale et Oncogénétique

Chef  du laboratoire : Dr Sonia ABDELHAK
Biologiste Principal, Génétique Humaine
sonia.abdelhak@pasteur.rns.tn
71 843 755 (poste 573)

Présentation générale :

Le laboratoire de Génomique BioMédicale et Oncogénétique (LGBMO) a été créé en 2012 en regroupant une partie des activités de recherche du service d’anatomie pathologique et expérimentale et celles du service de cytogénétique ainsi que les activités de l’unité de recherche sur l’investigation moléculaire des maladies orphelines d’origine génétique. Cette dernière a été elle-même créée en 2004 suite à l’évolution du groupe de recherche en génétique humaine mis en place depuis septembre 1997. Ainsi, depuis plus de vingt ans, nos travaux ont eu pour objectif principal l’investigation multi- disciplinaire des maladies génétiques rares dans la population tunisienne. L’évolution de nos activités de recherche nous a conduit à l’étude de maladies non-transmissibles communes, surtout dans leurs formes mendéliennes, en particulier les pathologies prédisposant aux cancers et au diabète.

Objectifs et projets de recherche :

Le laboratoire a pour objectif global d’étudier l’étiologie génétique et l’épigénétique des maladies non transmissibles (maladies génétiques rares, maladies dégénératives associées au vieillissement, cancers et diabètes). Il s’agit d’une recherche translationnelle qui vise à répondre à la priorité nationale de prévention des maladies non transmissibles. Il a été subdivisé en 4 projets de recherche :

- Le premier projet visait à identifier l’étiologie moléculaire des maladies génétiques rares par des approches génomiques et post-génomiques. Les approches post-génomiques font appel à des techniques de séquençage et de génotypage de nouvelle génération (NGS). Compte tenu du grand nombre de variants identifiés, ces approches nécessitent des analyses bioinformatiques assez poussées ainsi qu’une validation à l’échelle des familles de malades et de la population étudiée. Une validation fonctionnelle est également indispensable et nécessite l’utilisation de modèles cellulaires appropriés pour mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques associés.

- Le deuxième projet visait à étudier les facteurs génétiques prédisposant aux cancers et affectant leur progression afin d’identifier des biomarqueurs à valeur diagnostique, pronostique et ou théranostique. En plus des techniques classiques d’investigation histo-pathologiques et moléculaires, nous avons étudié le microenvironnement tumoral et nous avons fait appel à des outils NGS, transcriptomique et protéomique.

- Le troisième projet porte sur l’étude de la variabilité génomique des populations maghrébines et son impact sur la susceptibilité aux maladies métaboliques monogéniques et multifactorielles. L'intégration de données multidisciplinaires et l’utilisation des techniques de séquençage et de génotypage de nouvelle génération permettront d'identifier les mutations causales et des biomarqueurs à valeur diagnostique, de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques des maladies métaboliques et de mettre en place une médecine de précision en faveur des patients diabétiques en Tunisie.

- Le quatrième projet vise à étudier de manière pluridisciplinaire un groupe de maladies rares d’origine génétique qui prédisposent au vieillissement pathologique et ceci (i) en identifiant l’étiologie moléculaire pour confirmer le diagnostic clinique (ii) en explorant les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués, (iii) en investiguant de nouveaux outils de diagnostic et (iv) en proposant de nouvelles approches thérapeutiques. Les travaux de l’axe 4 se reposent sur l’utilisation de modèles cellulaires ultra-rares comme les cellules souches musculaires et de cultures primaires génotypées spécifiques à ces pathologies.

 

Composition du laboratoire :

 

Prénom, Nom

Titre /Fonction

Sonia ABDELHAK

Biologiste Principal/ Chef du laboratoire

Mohamed Samir BOUBAKER

Professeur/ Chef de Service

Laboratoire d’Anatomo-Pathologie Humaine et Expérimentale, IPT

Ahlem AMOURI

Professeur/ Chef de Service de Cytogénétique, IPT

Rym KEFI-BEN ATIG

Maître de conférences

Houda YACOUB

Biologiste Principal

Olfa MESSAOUD

Biologiste adjoint

Cherine CHARFEDDINE

Maitre-Assistant de l’Enseignement Supérieur

Najla MEZGHANI

Maître Assistant de l’Enseignement Supérieur

Lilia ROMDHANE

Maitre-Assistant de l’enseignement Supérieur

Haifa TOUNSI GUETITI

Assistant Hospitalo- Universitaire en Médecine

Hamouda BOUSSEN

Professeur/ Chef de Service d’Oncologie Médicale, Hôpital Abderrahmane Mami

Abdelmajid ABID

Ancien Professeur à la Faculté de Médecine de Tunis, médecin de libre pratique

Mohamed Moussadak AZZOUZ

Professeur/ Chef de Service de Gastro-entérologie, Hôpital Régional de Nabeul.

Meriem JONES

Maître de conférences Agrégée en Dermatologie

Emna CHELBI

Professeur  Agrégé

Nesrine MEJRI

Maître de conférences Agrégée en Oncologie Médicale

Wiem AYED

Maitre de conférences Agrégée en Histo-Embryologie

Rim ZAININE

Maitre de conférences Agrégée

Sonia BEN NASER

Assistante Hospitalo-Universitaire

Houda BELFKI

Assistante Hospitalo-Universitaire

Hanen BOUAZIZ

Assistante Hospitalo-Universitaire

Olfa SELMI

Assistante Hospitalo-Universitaire

Mariem GHARBI

Professeur d’enseignement paramédical

Cadres ayant un grade équivalent au grade d’assistant de l’enseignement supérieur

Maria KABBAGE

Chercheur Post doctorant

Yosr HAMDI

Biologiste adjoint contractuel

Nadia ZITOUNA

Chercheur Post doctorant

Meriem FASSATOUI

Chercheur Post doctorant

Haifa JMEL

Chercheur Post doctorant

Asma CHIKHAOUI

Chercheur Post doctorant

Hamza DALLALI

Chercheur Post doctorant

Wafa KAMMOUN REBAI

Chercheur Post doctorant

Ines BEN AYED

Chercheur Post doctorant

Amira JABALLAH

Chercheur Post doctorant

Hamza YAICHE

Chercheur Post doctorant

Doctorants (préparant une thèse de doctorat en sciences biologiques)

Nadia BEN JEMII

Etudiante en thèse es Sciences

Abir BELHAJ ALI

Etudiante en fin de thèse

Ghaith ABDESSALEM

Etudiant en fin de thèse

Meriem HECHMI

Etudiante en fin de thèse

Najah MIGHRI

Etudiante en fin de thèse

Maroua BOUJEMAA

Etudiante en thèse es Sciences

Rahma MKAOUAR

Etudiante en thèse es Sciences

Jihene BEN AISSA

Etudiante en thèse es Sciences

Sami BOUCHOUCHA

Etudiant en thèse es Sciences

Amel SAAIDI

Etudiant en thèse es Sciences

Khouloud ZAYOUD

Etudiante en thèse es Sciences

Nesrine MEZZI

Etudiante en thèse es Sciences

Nadia KHERIJI

Etudiante en thèse es Sciences

Dorra NAJJAR

Etudiante en thèse es Sciences

Dorra WIDER

Etudiante en thèse es Sciences

Dorra BECHER

Etudiante en thèse es Sciences

Rym JENNI

Etudiante en thèse es Sciences

Jihene MARRAKCHI

Etudiante en thèse es Sciences

Chokri NAOUALI

Etudiante en thèse es Sciences

Marwa SAYEB

Etudiante en thèse es Sciences

Nouha JENDOUBI

Etudiante en thèse es Sciences

Ichraf KRAOUA

Etudiante en fin de thèse

 

 

 

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