Institut Pasteur de Tunis - Actualités


Call for Application: Capacity Building in Research Methods and Ethics on: Good Health Research Practice (GHRP) July 28–31, 2023
Organized by
The Regional Training Center supported by TDR
for Eastern Mediterranean Region (EMR)
Institut Pasteur de Tunis,
Hammamet, Tunisia
Deadline of application: July 6th, 2023
Only applicants from the WHO Eastern Mediterranean Region are eligible.

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The Institut Pasteur of Tunis (IPT) is a Regional Training Center (RTC) for Health Research supported by Tropical Disease Research (TDR) for the Eastern Mediterranean Region (EMR). Its mandate is to improve the health research capacity skills of researchers in the region through short training courses on Good practices, Bioethics, Project planning and evaluation
and Implementation research. The TDR-supported RTC for EMR is launching the call of applications for the 5th Regional Course on Good Health Research Practices (GHRP) which will be held on July 28-31, 2023 in Tunisia. The GHRP course provides participants with the necessary knowledge and skills for human research management. It helps scientists to understand the importance of ethical and quality principles in the conduct of human health research.
MODULES
The participants of the GHRP course will build skills in biomedical and health research to develop well-structured competitive proposals with clear and realistic implementation and monitoring plans. The course, taught in English, will be held over 4 days. It will include the 5 following modules:
  • Good practices in biomedical research;
  • Concept and value of project planning and evaluation;
  • Defining the purpose and scope of the project;
  • Planning the project;
  • Implementing and evaluating a project.
PARTICIPANTS
Target participants: Up to 20 participants will be selected who are involved in public health research or/and public health professionals, such as epidemiologists, sociologists, etc..
Participants are expected to bring the study proposal they plan to implement. Each project has to be proposed by two investigators, and for each selected project, two researchers will be able to participate in this training (PI, Co-PI,..).
ELIGIBILITY
1. Only applicants from WHO-EMR region countries working in an institution within their regions are eligible.
2. They should be involved in health research and recommended by their Institution.
Upon selection, applicants have to bring their own proposal of the study which they plan to implement. For each selected project, two researchers will be able to participate in this training (e.g, PI, Co-PI, PhD..)

APPLICATION REQUIREMENT

1/ Complete the application form including the description of the proposed research.
Please note that the description of the proposed research section is important for the final selection of participants.
2/ Full CV
3/ Scanned copy of the visa application file
4/ Recommendation letter certifying the applicant's competency and how attending this course will help her/him progress the proposed project.
5/ Scanned copy of the first page of the passport (for international participants*)
All documents must be complete and have to be sent to: rtc.ipt@pasteur.utm.tn

SELECTION CRITERIA
Participants will be selected according to their motivation letter, the pertinence of their proposal outlines, and the provided recommendation letter.

SCHOLARSHIP
Expenses (except visa fees) for all selected participants will be supported by the organizers. Covered expenses include travel tickets (economic fare), Airport-Venue transfers, and accommodation. All other personal costs will not be covered by the organizers.
(**) Important: All selected participants must check before traveling if they need a Visa to enter Tunisia. Participants should obtain (at their own charge) visas to enter TUNISIA, before traveling.

Deadline of applicationJuly 6, 2023

FOR ANY INFORMATION PLEASE CONTACT:
Hamza YaichePhD, Assistant Project 'Regional Training Center (RTC)'
supported by TDR for East Mediterranean region (EMR)
Institut Pasteur de Tunis
Email: hamza.yaiche@pasteur.utm.tn
WhatsApp/Tel: (+216) 27962082
 
Workshop "Transformation et maintenance de souches d'E. coli pour produire des lots de plasmides servant de contrôle qualité pour les réactifs de PCR" 12-16 juin 2023

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L'Institut Robert Koch (RKI) en collaboration avec l'Institut Pasteur de Tunis (IPT)- Laboratoire LEMV  (Groupe de Bactériologie), et avec le soutien de la GIZ, organise un workshop intitulé: "Transformation et maintenance de souches d'E. coli pour produire des lots de plasmides servant de contrôle qualité pour les réactifs de PCR".

Cet atelier se déroulera du 12 au 16 juin 2023 à l'Institut Pasteur de Tunis,  et s'adresse aux membres scientifiques des laboratoires de bactériologie et de virologie de l'IPT et de l'Hôpital Charles Nicole, qui ont reçu une formation du RKI pour les méthodes de diagnostic implémentés dans leurs institutions dans le cadre du "Programme Allemand de Biosécurité".

L'objectif de cet atelier est de permettre à ces laboratoires un auto-approvisionnement continu et de qualité assurée en réactifs nécessaires pour les tests moléculaires mis en œuvre.

 

 

 
SEMINAIRE DE L'IPT (8 JUIN 2023) : Origine et succès du génotype le plus répandu de Mycobacterium tuberculosis en Tunisie, et dans le monde, tels que décryptés à partir de la séquence génomique

Naira DekhilLe dix-neuvième séminaire de l'IPT intitulé : Origine et succès du génotype le plus répandu de Mycobacterium tuberculosis en Tunisie, et dans le monde, tels que décryptés à partir de la séquence génomique sera assuré par Dr. Naira DEKHIL, Post-doctorante au Laboratoire de Microbiologie Moléculaire, Vaccinologie et Developpement Technologique (MMVDB)  à l'Institut Pasteur de Tunis.

Il aura lieu le jeudi 8 juin 2023 à 11h00 dans le Grand amphithéâtre de l'IPT.

Le séminaire sera diffusé en direct sur la chaine youtube de l'IPT

Résumé : La sous-lignée latino-américaine et méditerranéenne (Latin-American and Mediterranean; LAM) de Mycobacterium tuberculosis (L4.3/LAM) est la plus répandue dans le monde. Cependant, certains génotypes L4.3/LAM se sont révélés fortement liés à des populations particulières, très probablement à la suite d'une évolution adaptative. Nous avons exploré l'histoire évolutive d'un complexe clonal L4.3/LAM (CC), TUN4.3_CC1, qui est particulièrement prospère en Tunisie, et dévoilé les changements génomiques qui sous-tendent son adaptation locale réussie. Des analyses phylogénomiques couplées à des analyses phylogéographiques ont indiqué que TUN4.3_CC1 a évolué localement et est principalement confiné à l'Afrique du Nord. Les analyses de maximum de vraisemblance ont révélé des preuves de sélection positive opérant sur la branche ayant donné naissance à ce complexe clonal. Plusieurs mutations ponctuelles, principalement dans la catégorie des gènes « paroi cellulaire et processus cellulaires », notamment en relation avec le système de sécrétion ESX/type VII, seraient impliqués dans le succès de TUN4.3_CC1. Deux, en particulier, au niveau des gènes esxK et eccC2 se sont révélés spécifiques à TUN4.3_CC1, et communs à presque tous les isolats. Il convient de noter que la mutation dans le gène esxK est homoplasique, indiquant ainsi qu'elle pourrait avoir potentiellement doté TUN4.3_CC1 d'un avantage sélectif. De plus, nous avons remarqué l'apparition d'une autre mutation homoplasique dans le gène Rv0197, une oxydo-réductase, précédemment corrélée à une transmissibilité accrue in vivo. En conclusion, nos analyses ont dévoilé plusieurs caractéristiques qui expliqueraient le succès d'un complexe clonal du génotype L4.3/LAM, mettant en lumière le rôle critique des gènes codés par le système de sécrétion ESX/type VII.

Biographie de Naira DEKHIL : Durant sa thèse de Doctorat, elle a étudié la génomique comparative et fonctionnelle des souches résistantes aux antibiotiques de Mycobacterium tuberculosis, l'agent causal de la tuberculose humaine (TB). Elle est actuellement chercheuse postdoctorale à l'Institut Pasteur de Tunis, Unité de Typage et Génétique des Mycobactéries. Depuis 2017, elle travaille sur l'analyse phylodynamique des souches de M. tuberculosis. Elle est membre du projet PRF: Développement d'une stratégie de réduction de l'impact de la tuberculose bovine chez l'homme basée sur le concept « One Health ».

 
Académie de Médecine de Précision du projet PerMediNA du 12 au 23 Juin 2023
Jeudi, 01 Juin 2023 14:47

Normal 0 21 false false false FR X-NONE AR-SA PMA FinalL'Institut Pasteur de Tunis organise dans le cadre des activités de formation du projet PerMediNA "Personalized Medicine in North Africa" l'Académie de Médecine de Précision à Tunis (PMA) du 12 au 23 Juin 2023.

L'Académie de Médecine de Précision comprend une série de conférences, de tables rondes et de sessions interactives animées par des experts reconnus, dans le domaine de de la médecine de précision. Les thèmes abordés incluent la génomique, l'analyse de données massives, les biobanques, les technologies de séquençage, les essais cliniques et précliniques, la génomique fonctionnelle, l'éthique et l' implémentation de la médecine de précision.Cette académie est divisée en trois grandes parties : Du 12 au 17 Juin 2023 : Une partie théorique qui réunira des experts qui partageront leurs connaissances avec les participants de la PMA et discuteront des dernières avancées. Cette partie est divisée en 4 grands modules :

- Module I: Introduction à la médecine de précision, l'éthique, la réglementation et la gouvernance
- Module II: Biobanques, séquençage et analyse de données
- Module III: Génomique Fonctionnelle
- Module IV: Écosystème, Essais précliniques et cliniques

Des quiz seront proposés tout au long de la session, offrant aux participants l'occasion de tester leurs connaissances. Des trophées seront remis à ceux qui se seront démarqués lors de cette partie théorique de la PMA. Les interventions réalisées par ces experts lors de cette partie seront enregistrées et partagées sur la chaîne YouTube ainsi que les réseaux sociaux de l'Institut Pasteur de Tunis et du projet PerMediNa. Cela permettra à un public plus large de bénéficier des connaissances partagées par ces experts de renommée mondiale dans le domaine de la médecine de précision.

Du 21 au 22 Juin 2023 Cette partie est réservée aux participants des institutions partenaires du projet PerMediNA. Elle vise principalement les cliniciens, oncologues, généticiens et biologistes moléculaires, offrant une occasion unique d'approfondir leurs connaissances sur les réunions de concertation pluridisciplinaire (RCP) moléculaires.

Du 21 au 23 Juin 2023 à l'Institut Pasteur de Tunis : Cette session est spécialement dédiée aux participants des institutions partenaires du projet PerMediNA ayant des connaissances en génomique et bioinformatique. Les participants auront l'opportunité d'approfondir leurs compétences en analyse de données génomiques et transcriptomiques à travers des exercices pratiques (Hands-on), des cours spécialisées et des études de cas pratiques.

Vous trouverez plus d'informations sur le projet PerMediNA sur le site web de l'IPT : www.pasteur.tn et en suivant les actualités du projet sur les réseaux sociaux: Facebook , Linkedin, Twitter N'hésitez pas à contacter l'équipe coordinatrice pour tout renseignement complémentaire Contact : permedina@pasteur.utm.tn.

 
SEMINAIRE DE L'IPT (25 MAI 2023) : APLASIE MEDULLAIRES CONSTITUTIONNELLES : PLACE DE LA GENETIQUE

wiem ayedLe dix-huitième séminaire de l'IPT intitulé : Aplasie médullaires constitutionnelles : place de la génétique sera assuré par Pr.Ag. Wiem AYED, professeur agrégée au laboratoire d'Histologie et de Cytogénétique Médicale à l'Institut Pasteur de Tunis.

Il aura lieu le jeudi 25 mai 2023 à 11h00 dans le Grand amphithéâtre de l'IPT. Le séminaire sera diffusé en direct sur la chaine youtube de l'IPT

Résumé : L'aplasie médullaire est une insuffisance médullaire quantitative, secondaire à la disparition complète ou partielle du tissu hématopoïétique, sans prolifération cellulaire anormale (l'aplasie médullaire n'est pas un cancer). Il existe différents mécanismes contribuant à la survenue d'une aplasie médullaire : la plupart des aplasies sont dites idiopathiques (à priori auto-immunes), 15 à 20% sont constitutionnelles et certaines sont favorisées par l'exposition à des agents toxiques ou médicamenteux (1 à 2%). Les aplasies médullaires constitutionnelles (AMC) sont des pathologies rares touchant essentiellement les enfants. Elles sont secondaires à une anomalie génétique, responsable le plus souvent d'un défaut intrinsèque de la cellule souche hématopoïétique et altérant trois mécanismes : la réparation de l'ADN, la biologie des télomères ou le métabolisme ribosomal. Grâce aux progrès de la génétique moléculaire au cours de la dernière décennie, plusieurs syndromes ont pu être identifiés. Les principales AMC sont la maladie de Fanconi, les téloméropathies (anciennement nommées dyskératoses congénitales) et l'amégacaryocytose congénitale.Les autres pathologies constitutionnelles responsables de pancytopénies centrales et pouvant occasionnellement se présenter comme des aplasies médullaires sont le syndrome de Shwachman Diamond, le syndrome GATA2, l'anémie de Blackfan-Diamond (aplasie rarement sévère si on considère les données de l'hémogramme). Enfin, de nombreuses autres entités génétiques ont été récemment identifiées comme les syndromes SAMD9/SAMD9L. Le traitement curatif des AMC repose sur la greffe de cellules souches hématopoïétiques (CSH). Le diagnostic cytogénétique de l'AF est primordial pour la prise en charge des patients candidats à la greffe de CSH. Par ailleurs, l'identification des gènes en cause permet de faire un conseil génétique à la famille, de sélectionner un donneur apparenté sain et de programmer un diagnostic prénatal pour les grossesses ultérieures.

Biographie de Wiem AYED : ·        
Médecin Histologiste Embryologiste et Cytogénéticienne, pasteurienne depuis 2009 en tant que résidente puis Assistante Hospitalo Universitaire en 2012 et Professeur Agrégée depuis 2017 à la Faculté de Médecine de Tunis.
Titulaire d'un Master de Recherche en Génétique et Physiologie de l'Université d'Auvergne en France (Juin 2012).
Membre de Laboratoire de recherche de Génomique Biomédicale et Oncogénétique.

 
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