Cet atelier est destiné à des étudiants en thèse et à de jeunes chercheurs en génétique humaine de l’IPT et d’autres institutions d’enseignement et de recherche de la région. Son objectif est de présenter les avancées des nouvelles technologies -à haut débit et à haute densité- de séquençage et de génotypage pour la recherche de gènes impliqués dans les maladies génétiques. Cet atelier sera composé de conférences, d'exposés méthodologiques et de travaux pratiques où les participants seront initiés à l’utilisation d'outils d’analyse pour le traitement des résultats de la sortie du séquençeur jusqu’à leur interprétation biologique.
Organisation Durée : 5 jours Dates : 4-8 mars 2013 Cours théoriques et pratiques, Travaux Pratiques sur ordinateurs, présentation de projets des participants Nombre de participants maximum : 25 Langue : Français Lieu : Institut Pasteur de Tunis
Thèmes de l'atelier - Présentation de différentes technologies de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et de génotypage WGS (Whole Genome Séquencing), Séquençage exome (Whole Exome Sequencing), ARN séq... - Présentation et utilisation des bases de données génétiques - Initiation à la manipulation des fichiers de résultats en sortie de séquençage - Mapping, identification, filtrage et annotation des variants - Initiation à Galaxy, une infratructure informatique pour l’analyse des résultats NGS - Conférences illustrant l'utilisation de ces technolologies - Présentation et discussion de sujets de recherches des participants - Projets post-atelier
Critère de sélection des candidats La sélection des candidats se basera sur les motivations scientifiques du candidat, la pertinence du projet de recherche et sa cohérence par rapport à l’objectif du cours ainsi que sur la qualité de la lettre de motivation et du dossier de candidature.
Langue Français et quelques conférences en anglais
Comité scientifique Odile Kalogeropoulos (IP) Sonia Abdelhak (IPT)
Comité d’organisation local Rym Kefi (IPT) Mbarka Bchetnia (IPT) Olfa Messaoud (IPT) Mariem Ben Rekaya (IPT)
Comité de sélection Odile Kalogeropoulos (IP) Christiane Bouchier (IP) Béatrice Regnault (IP) Rym Benkhalifa (IPT) Houda Yacoub (IPT)
Chargés de communication Hichem Ben Hassine (IPT) Yosra Bouyacoub (IPT)
Conférenciers, Enseignants et Moniteurs Christiane Bouchier (plateforme Génomique IP) Sophie Créno (plateforme Génomique IP) Imen Dorboz (Inserm U676, Hopital Robert Debré, Paris) Béatrice Regnault (plateforme Génotypage des Eucaryotes, IP) Ken Mc Elereavey (Génétique du développement humain, IP) Anu Bashamboo (Génétique du développement humain, IP) Kais Ghedira (IPT) Najla Kharrat (CBS) Lilia Romdhane (IPT)
Logistique Khaled Lasram (IPT) Chokri Naouali (IPT)
Secrétariat Safa Romdhane (IPT)
Inscription : date limite 15 décembre 2012 Télécharger le formulaire d'inscription Télécharger le programme du cours
Contacts genomedika@gmail.com www.genomedika.org |