Dans le cadre des “visites d'experts” du projet PHINDaccess, une délégation de la plateforme technologique Biomics de l’Institut de Pasteur de Paris (IP) https://research.pasteur.fr/fr/team/biomics/ s’est déplacée à l’Institut de Pasteur de Tunis (IPT) du 27 au 31 décembre 2021. La délégation est composée de Dr. Imène Najjar, chef de projets et Mme Laurence Ma, technicienne supérieure en new-generation sequencing (NGS).

Cette visite est la première d’une série planifiée jusqu’à septembre 2022. Le but global étant de mettre en place à l’IPT une plateforme de service spécialisée en séquençage de deuxième génération (short-read) et capable de répondre aux besoins des chercheurs de l'Institut Pasteur de Tunis dans les domaines de la génomique, de la métagénomique et de la transcriptomique.

Ce premier séjour scientifique à l’IPT avait comme objectif principal la préparation des formations pratiques en NGS qui se tiendront in situ tout au long de l’année.

Ainsi, avec les membres de la plateformes de lIPT, la délégation de Biomics a mené à bien:

● l’agencement des paillasses ARN et ADN destinées aux étapes pré-séquençage,

● l’agencement des paillasses destinées aux différents contrôles de la qualité et au séquençage utilisant le séquenceur iSeq 100 (en cours d’acquisition par l’IPT),

● le test des fonctionnalités des équipements existants à la plateforme de l’IPT,

● et l'établissement de l’inventaire du matériel requis à acquérir pour les formations à venir.

Ce séjour marque le début de la deuxième étape du projet de transfert des compétences en NGS entre Biomics et l’IPT. Cette étape vise à renforcer et pérenniser les compétences acquises lors des séjours à Biomics.

En effet, le transfert technologique entre Biomics et la plateforme de l’IPT se déroule en deux phases. La première étant les formations des ingénieurs et de la responsable de l’IPT à Biomics entre septembre 2021 et février 2022.
Dans ce cadre, Saïf Azouz a été formé à Biomics par Laurence Ma à la génomique. Sinda Zarrouk a été formée aux bases du management total, aux outils et méthodes de gestion de projets et au déploiement du référentiel ISO9001 par Imène Najjar et Marc Monot. La formation de Mohamed Zouari en transcriptomique est prévue par Elodie Turc en février 2022.